In 1989 wordt de Financial Action Task Force on money laundering (FATF) opgericht. Nederland is één van de eerste leden en houdt zich vanaf de oprichting aan de aanbevelingen van de FATF. Meer informatie over de FATF en de aanbevelingen leest u hier.

In 1991 wordt de eerste Anti-Money Laundering Directive (AMLD) gepubliceerd. Deze richtlijn is bedoeld om te voorkomen dat criminelen financiële instellingen misbruiken om geld wit te wassen en geeft richtlijnen voor onder andere transactiemonitoring en Know Your Customer.

In 1994 krijgen Nederlandse banken en andere financiële instellingen een meldingsplicht voor het melden van ongebruikelijke transacties bij het Meldpunt Ongebruikelijke Transacties (MOT). MOT onderzoekt deze meldingen en verklaart transacties verdacht. Dit meldpunt is één van de voorlopers van de FIU-Nederland.

In 1995 wordt de Egmont Group opgericht; een internationaal samenwerkingsverband tussen FIU’s.

In 1999 start het Bureau ter politiële ondersteuning van de Landelijke Officier van Justitie inzake de Wet MOT (BLOM). Dit is één van de voorlopers van de FIU-Nederland.

De terroristische aanslagen van 11 september 2001 zijn een keerpunt. Vanaf 2001 richt de FATF zich niet langer alleen op witwassen, maar ook op de financiering van terrorisme.

Vanaf 2003 hebben onder meer makelaars, belastingadviseurs, advocaten, notarissen en accountants meldingsplicht.

Deze derde richtlijn is de eerste waarin ook aandacht is voor terrorismefinanciering.

In 2006 fuseren het MOT en het BLOM tot de FIU-Nederland zoals we die nu kennen.

Sinds 2008 geldt de Wet ter voorkoming van witwassen en financieren van terrorisme (Wwft). De wet vervangt de Wet identificatie bij dienstverlening (Wid) en de Wet melding ongebruikelijke transacties (Wet MOT). In de Wwft verwerkt Nederland de Europese richtlijnen. Ook krijgt de FIU-Nederland haar definitieve status.

De eilanden Bonaire, Sint Eustatius en Saba zijn tot Nederland gaan behoren. Dienstverleners die zijn gevestigd op de BES-eilanden, Caribisch Nederland geheten, dienen de ongebruikelijke transacties te melden bij de FIU-Nederland. Dit doen zij op basis van de Wwft BES.

De FIU-Nederland maakt sinds 1 januari 2013 formeel onderdeel uit van de rechtspersoon Staat der Nederlanden. Beheersmatig is de FIU-Nederland ondergebracht bij de Nationale Politie als een zelfstandig, onafhankelijk opererende entiteit. Beleidsmatig valt ze onder het Ministerie van Justitie en Veiligheid.

Wisseldiensten tussen fiduciaire en virtuele valuta krijgen meldingsplicht, samen met aanbieders van bewaarportemonnees.

Op 11 februari 2021 is het Fintell Alliance alliantiedocument ondertekend. Hiermee werd de publiek-private samenwerking (PPS) tussen ABN AMRO, ING, Rabobank, Volksbank, Knab en de FIU-Nederland officieel vastgelegd.